ОТДЕЛ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ БИОХИМИИ БИОПОЛИМЕРОВ
Отдел организован в 1965 году акад. А.Н. Белозерским.
С 1967 г. по 1997 г. заведующим отделом был чл.-корр. РАН, проф. Б.Ф. Поглазов
(1930-2001). С 1997 г. по настоящее время отдел возглавляет чл.-корр. РАН,
акад. РАМН, проф. В.А. Ткачук.
В структуру отдела входят лаборатория
структуры и функции цитоскелета (зав. – акад. А.С. Спирин), лаборатория
биохимии двигательных систем (зав. – дбн А.Л. Метлина), лаборатория
белков растений (зав. – дбн. М.А. Белозерский), научные
группы механизмов старения организмов (кбн С.Э. Мансурова), физиологии
клетки (кбн И.М. Бужурина), микробиологическая группа (кбн Л.П.
Родикова). Основные сотрудники отдела: дбн
Я.Е. Дунаевский, дбн Д.И. Левицкий, дбн Е.С. Надеждина, кбн А.В. Бураков,
кбн Л.А. Зиновкина, кбн П.А. Иванов, кбн О.П. Николаева, кбн Т.М. Новикова,
кбн Е.Н. Элпидина; И.Ф. Бухова, Н.К. Метелкина, О.Б. Соловьянова.
Отдел ведет научные исследования по следующим основным направлениям.
Изучение молекулярных основ явлений биологической подвижности в сравнительно-эволюционном
аспекте (исследование структуры и свойств белков двигательных систем – миозин,
актин, тропомиозин, флагеллин; исследование структуры, белкового состава
и функций цитоскелетных структур клеток позвоночных животных). Исследование
взаимодействия растений с патогенами и насекомыми. Изучение механизмов старения
организмов на модельных системах. Изучение клеточных механизмов формирования
ответа клеток на внешние воздействия.
Участие в выполнении научно-исследовательских проектов
(программ) и грантовая поддержка. Госпрограмма "Выяснение
молекулярных основ явлений биологической подвижности в сравнительно-эволюционном
аспекте"; Федеральная программа поддержки ведущих научных школ РФ "Изучение
молекулярных механизмов явлений биологической подвижности"; "Studies on the
thermal unfolding of actin-bound tropomyosin as a new approach for elucidating
of regulatory functions of tropomyosin" (Wellcome Trust). Гранты: ряд грантов
РФФИ, в том числе Россия-Италия, Россия-Беларусь, РФФИ-БФФИ, Федеральной
программы «Ведущие научные школы», Международного научного фонда Сороса,
CRDF, Wellcome Trust, Fogarty International Research, НАТО.
Основные научные достижения отдела.
Внесен фундаментальный вклад в изучение молекулярной организации
Т-четных бактериофагов [Poglazov BF, Mesanginov VV. Crystallization of the
proteins of the head of bacteriophage T2 in vitro. Virology, 1967; 31: 449-52;
Poglazov BF, Nikolskaya TI. Self-assembly of the protein of phage T2 tail
core. J Mol Biol. 1969; 43: 231-3; Poglazov BF. Morphohenesis of T-even bacteriophages.
N.Y., Karger Press, 1973] и молекулярного строения и сборки систем биологической
подвижности [Poglazov BF. Structure and function of contractile proteins.
Acad. Press, USA, 1966; Поглазов БФ. Сборка биологических структур. "Наука",
1970; Поглазов БФ, Левицкий ДИ. Миозин и биологическая подвижность, "Наука",
1982]. Впервые в России начата работа по изучению структуры бактериального
жгутика как двигательной органеллы прокариот. Предложена экспериментальная
модель, позволяющая продемонстрировать механизм сборки нитей бактериальных
жгутиков [Novikov VV, Metlina AL, Poglazov BF. A study on the of polymerisation
of Bacillus brevis flagellum. Biochem Mol Biol Intern. 1994; 33: 723-8].
Впервые обнаружены актиноподобные свойства флагеллина бактериальных жгутиков
в составе их нитей [Novikova NA, Levitsky DI, Metlina AL, Poglazov BF. Interaction
of bacterial flagellum filaments with skeletal muscle myosin. IUBMB Life.
2000; 50: 385-90] Впервые продемонстрировано различие во внутриклеточном
крепления жгутиков бактерий и архей как органелл подвижности двух представителей
прокариотических организмов [Бакеева и др. Ультраструктура двигательного
аппарата Halobacterium salinarium. Докл РАН. 1992; 326: 914-5]. Разработан
методический подход для регистрации структурных перестроек мышечных белков
(головки миозина, актин, тропомиозин) в процессе их функционирования. Установлено,
что в процессе АТФазной реакции головки миозина подвергаются глобальным
структурным перестройкам, сопровождаемым значительными изменениями в доменной
структуре белка. Обнаружены значительные конформационные изменения головок
миозина и тропомиозина, вызываемые взаимодействием этих белков с актиновыми
филаментами [Ponomarev et al. Charge changes in loop 2 affect the thermal
unfolding of the myosin motor domain bound to F-actin. Biochemistry 2000;
39: 4527-32; Kaspieva et al. Changes in the thermal unfolding of p-phenylenedimaleimide-modified
myosin subfragment 1 induced by its “weak” binding to F-actin. FEBS Lett.
2001; 489: 144-8; Nikolaeva OP, Orlov VN, Bobkov AA, Levitsky DI. Differential
scanning calorimetric study of myosin subfragment 1 with tryptic cleavage
at the N-terminal region of the heavy chain. Eur J Biochem. 2002; 269: 5678-88].
Впервые продемонстрирована АТФазная активность кинезина и ее стимуляция микротрубочками.
Изучена четвертичная структура кинезина и доменная организация его молекулы.
Идентифицирована легкая цепь белка МАР1 – важнейшая часть его молекулы [Kuznetsov
SA, Gelfand VI. Bovine brain kinesin is a microtubule-activated ATPase. Proc
Natl Acad Sci USA. 1986; 83: 8530-4; Kuznetsov et al. Identification of a
34 kD polypeptide as a light chain of microtubule-associated protein-1 (MAP-1)
and its localization to the microtubule-binding region of the molecule.
J Cell Biol. 1986; 102: 1060-6; Kuznetsov et al. The quaternary structure
of bovine brain kinesin. EMBO J. 1989; 7: 353-6]. Идентифицирована новая
протеинкиназа животных клеток LOSK и показано ее участие в формировании
радиальной системы микротрубочек. Показано участие микротрубочек в формировании
в клетках стресс-гранул, включающих в себя компоненты комплекса инициации
трансляции. Продемонстрирована роль актомиозина и диненина в позиционировании
центросомы в животных клетках [Zinovkina LA, Poltaraus AB, Solovyanova OB,
Nadezhdina ES. Chinese hamster protein homologous to human putative protein
kinase KIAA0204 is associated with nuclei, microtubules and centrosomes in
CHO-K1 cells. FEBS Lett. 1997; 414: 135-9; Потехина ЕС, Зиновкина ЛА, Надеждина
ЕС. Ферментативная активность протеинкиназы LOSK: возможная роль регулятора
структурного домена. Биохимия. 2003; 68: 188-95; Burakov A, Nadezhdina E,
Slechenko B, Rodionov V. Centrosome positioning in interphase cells. J Cell
Biol. 2003; 162: 963-9]. Изучен механизм мобилизации запасных белков в семенах
высших растений (гречиха, пшеница, рожь) и предложена схема протекания этого
процесса при прорастании семян [Belozersky MA, Dunaevsky YE, Voskoboynikova
NE. Isolation and properties of a metalloproteinase from buckwheat seeds.
Biochem J. 1990; 272: 677-82; Elpidina EN, Voskoboynikova NE, Belozersky
MA, Dunaevsky YE. Localization of a metalloproteinase and its inhibitor in
the protein bodies of buckwheat seeds. Planta. 1991; 185: 46-52; Dunaevsky
YE, Belozersky MA. In vitro reconstitution of the proteolytic system responsible
for hydrolysis of the 13S globulin in buckwheat seeds. FEBS Lett. 1993; 324:
216-8]. Получены и охарактеризованы 7 ингибиторов протеаз из семян гречихи.
С целью повышения устойчивости растений к патогенам осуществлена трансформация
растений табака и хрена геном этого ингибитора. Изучено взаимодействие секретируемых
протеолитических ферментов мицелиальных грибов с растительными ингибиторами
протеаз. Показано, что грибы-фитопатогены секретируют трипсин-подобные протеиназы,
а грибы-сапротрофы – субтилизин-подобные ферменты [Belozersky MA, Dunaevsky
YE, Musolyamov AK, Egorov TA. Complete amino acid sequence of the protease
inhibitor from buckwheat seeds. FEBS Lett. 1995; 371: 264-6; Dunaevsky YE,
Gruban TN, Beliakova GA, Belozersky MA. Comparative study of proteases of
pathogenic and saprophytic filamentous fungi. Plant Protection Science. 2002;
38: 61-3]. С целью повышения устойчивости растений к насекомым-вредителям
исследован спектр пищеварительных протеиназ распространненого вредителя
большого мучного хрущака [Elpidina et al. Compartmentalization of proteinases
and amylases in Nauphoeta cinerea midgut. Arch Insect Biochem hysiol. 2001;
8: 206-16; Elpidina et al. Proteinase inhibitors in Nauphoeta cinerea midgut.
Arch Insect Biochem Physiol. 2001; 48: 217-22].
Научные достижения отдела отмечены премиями АН СССР совместно
с Польской Академией Наук (Д.И. Левицкий) и Минвуза (М.А. Белозерский, Я.Е.
Дунаевский).
Основные научные публикации отдела:
1. Poglazov BF. Structure and functions of contractive proteins.
N.Y.: Acad. Press, 1966.
2. Poglazov BF, Mesanginov VV. Crystallization of the proteins of
the head of bacteriophage T2 in vitro. Virology. 1967; 31: 449-52.
3. Поглазов БФ, Левицкий ДИ. Миозин и биологическая подвижность.
М.: Наука. 1972.
4. Poglazov BF. Morphohenesis of T-even bacteriophages. NY, Karger
Press, 1973.
5. Venjaminov SYu, Rodikova LP, Metlina AL, Poglazov BF. Secondary
structure change of bacteriophage T4 sheath protein during sheath contraction.
J Mol Biol. 1975; 98: 657-64.
6. Kulaev IS, Mansurova SE, Burlakova EB, Dukhovich VF. Why ATP instead
of pyrophosphate? Interrelationship between ATP and pyrophosphate production
during evolution and in contemporary organisms. Bio Systems. 1980; 12: 177-80.
7. Новиков ВВ, Метлина АЛ, Поглазов БФ. Способ полимеризации флагеллина.
Авторское свидетельство № 3008188/13 от 17.10.1980.
8. Rodionov VI, Nadezhdina ES, Leonova EV, Vaisberg EA, Kuznetsov
SA, Gelfand VI. Identification of a 100 kD protein associated with microtubules,
intermediate filaments and coated vesicles in cultured cells. Exp Cell Res.
1985; 159: 377-87.
9. Kuznetsov SA, Gelfand VI. Bovine brain kinesin is a microtubule-activated
ATPase. Proc Natl Acad Sci USA. 1986; 83: 8530-34.
10. Kulaev IS, Mansurova SE, Shakhov YuA. Isolation and reconstitution
of mambrane – bound pyrophosphatase from beef heart mitochondria. Methods
in Enzymol. 1986; 126: 447-54.
11. Dunaevsky YE, Belozersky MA. Proteolysis of the main storage
protein of buckwheat seeds at the early stage of germination. Physiol Plant.
1989; 75: 424-8.
12. Dunaevsky YE, Belozersky MA. The role of cysteine proteinase
and carboxypeptidase in the breakdown of storage proteins in buckwheat
seeds. Planta. 1989; 179: 316-22.
13. Mansurova SE. Inorganic pyrophpsphate in mitochondrial metabolism.
Biochim Biophys Acta. 1989; 977: 237-47.
14. Rodionov VI, Gyoeva FK, Gelfand VI. Kinesin is responsible for
centrifugal movement of pigment granules in melanophores. Proc Natl Acad
Sci USA. 1991; 88: 4956-960.
15. Elpidina EN, Voskoboynikova NE, Belozersky MA, Dunaevsky YE.
Localization of a metalloproteinase and its inhibitor in the protein bodies
of buckwheat seeds. Planta. 1991; 185: 46-2.
16. Бакеева ЛЕ, Метлина АЛ, Новикова ТМ, Сперанский ВВ. Ультраструктура
двигательного аппарата Halobacterium salinarium. Докл РАН. 1992; 326: 914-15.
17. Dunaevsky YE, Belozersky MA. In vitro reconstitution of the proteolytic
system responsible for hydrolysis of the 13S globulin in buckwheat seeds.
FEBS Lett. 1993; 324: 216-8.
18. Novikov VV, Metlina AL, Poglazov BF. A study on the of polymerisation
of Bacillus brevis flagellum. Biochem Mol Biol Int. 1994; 33: 723-28.
19. Bobkov AA, Levitsky DI. Differential scanning calorimetric study
of the complexes of myosin subfragment 1 with nucleoside diphosphates and
vanadate or beryllium fluoride. Biochemistry. 1995; 34: 9708-13.
20. Belozersky MA, Dunaevsky YE, Musolyamov AX, Egorov TA. Complete
amino acid sequence of the protease inhibitor from buckwheat seeds. FEBS
Lett. 1995; 371: 264-66.
21. Zinovkina LA, Poltaraus AB, Solovyanova OB, Nadezhdina ES. Chinese
hamster protein homologous to human putative protein kinase KIAA0204 is
associated with nuclei, microtubules and centrosomes in CHO-K1 cells. FEBS
Lett. 1997; 414: 135-39.
22. Levitsky DI, Ponomarev MA, Geeves MA, Shnyrov VL, Manstein DJ.
Differential scanning calorimetric study of the thermal unfolding of the
motor domain fragments of Dictyostelium discoideum myosin II. Europ J Biochem.
1998; 251: 275-80.
23. Novikova NA, Levitsky DI, Metlina AL, Poglazov BF. Interaction
of bacterial flagellum filaments with skeletal muscle myosin. IUBMB Life.
2000; 50: 385-90.
24. Levitsky DI, Rostkova EV, Orlov VN, Nikolaeva OP, Moiseeva LN,
Teplova MV, Gusev NB. Complexes of smooth muscle tropomyosin with F-actin
studied by differential scanning calorimetry. Eur J Biochem. 2000; 267:
1869-77.
Основные публикации за последние 3 года:
1. Метлина АЛ. Жгутики прокариот как система биологической подвижности.
Успехи биол. химии. 2001; 41: 229-82.
2. Muntz K, Belozersky MA, Dunaevsky YE, Schlereth A, Tiedemann J.
Stored proteinases and the initiation of storage protein mobilization in
seeds during germination and seedling growth. J Exp Botany. 2001; 52: 1741-52.
3. Надеждина ЕС, Зиновкина ЛА, Файс Д, Ченцов ЮС. Сперматозоиды вьюна
Misgurnus fossilis как объект для идентификации новых белков центросом.
Онтогенез. 2001; 32: 45-50.
4. Rodionov V, Nadezhdina E, Peloquin J, Borisy G. Digital fluorescence
microscopy of cell cytoplasts with and without the centrosome. Methods Cell
Biol. 2001; 67: 43-51.
5. Шанина НА, Иванов ПА, Чудинова ЕМ, Северин ФФ, Надеждина ЕС. Фактор
инициации трансляции eIF3 способен связываться с микротрубочками в клетках
млекопитающих. Молек биол. 2001; 35: 638-46.
6. Kaspieva OV, Nikolaeva OP, Orlov VN, Ponomarev MA, Levitsky DI.
Changes in the thermal unfolding of p-phenylenedimaleimide-modified myosin
subfragment 1 induced by its “weak” binding to F-actin. FEBS Lett. 2001;
489: 144-8.
7. Dunaevsky YE, Gruban TN, Beliakova GA, Belozersky MA. Comparative
study of proteases of pathogenic and saprophytic filamentous fungi. Plant
Protection Science. 2002; 38: 61-3.
8. Потехина ЕС, Зиновкина ЛА, Надеждина ЕС. Ферментативная активность
протеинкиназы LOSK: возможная роль регулятора структурного домена. Биохимия.
2003; 68: 188-95.
9. Nikolaeva OP, Orlov VN, Bobkov AA, Levitsky DI. Differential scanning
calorimetric study of myosin subfragment 1 with tryptic cleavage at the
N-terminal region of the heavy chain. Eur J Biochem. 2002; 269: 5678-88.
10. Tsiavaliaris G, Fujita-Becker S, Batra R, Levitsky DI, Kull FJ,
Geeves MA, Manstein DJ. Mutations in the relay loop region result in dominant-negative
inhibition of myosin II function in Dictyostelium. EMBO Rep. 2002; 3: 1099-105.
11. Zubov EO, Levitsky DI. Tight coupling between the motor domain
and the regulatory domain of the myosin head complexed with ADP and phospahate
analogues. J Muscle Res Cell Motil. 2002; 23: 15.
12. Kremneva EV, Nikolaeva OP, Gusev NB, Levitsky DI. Effects of
troponin on the thermal unfolding of actin-bound tropomyosin. J Muscle
Res Cell Motil. 2002; 23: 23.
13. Nikolaeva OP, Dedova IV, Mikhailova VV, Levitsky DI. Effects
of cofilin on the thermal unfolding of actin. J Muscle Res Cell Motil.
2002; 23: 24-5.
14. Burakov A, Nadezhdina E, Slechenko B, Rodionov V. Centrosome
positioning in interphase cells. J Cell Biol. 2003; 162: 963-9.
15. Ivanov PA, Chudinova EM, Nadezhdina ES. RNP stress-granule formation
is inhibited by microtubule disruption. Cell Biol Int. 2003; 27: 207-8.
16. Markova OV, Evstafieva AG, Mansurova SE, Moussine SS, Palamarchuk
LA, Pereverzev MO, Vartapetian AB, Skulachev VP. Cytochrome c is transformed
from anti- to pro-oxidant when interacting with truncated oncoprotein prothymosin
α. Biochim Biophys Acta. 2003; 1557: 109-17.
17. Tsybina T, Dunaevsky Y, Musolyamov A, Egorov T, Larionova N,
Popykina N, Belozersky M. New protease inhibitors from buckwheat seeds:
properties, partial amino acid sequences and possible biological role.
Biol Chem. 2004; 385: 429-34.
Другие сведения об отделе. Отдел организован акад. А.Н. Белозерским
на базе нескольких научных групп, работавших на кафедре биохимии растений
биолого-почвенного факульета МГУ. В дальнейшем часть групп получила статус
лабораторий в рамках отдела, и в настоящее время его тематика включает
несколько самостоятельных научных направлений. С 1967 г. по 1997 г. отдел
возглавлял выдающийся биохимик, один из основателей российской научной
школы по изучению биологической подвижности, чл.-корр. РАН, проф. Борис
Федорович Поглазов (1930-2001). Фундаментальные работы Б.Ф. Поглазова, посвященные
изучению биологической подвижности и механизмов сборки элементарных надмолекулярных
биологических структур, получили мировую известность.